Der Masterstudiengang wendet sich hauptsächlich an Personen mit mindestens einjähriger Berufserfahrung im Bereich der Medizinphysik und -technik sowie in fachlich nahestehenden Gebieten (die außer in Klinken, Großpraxen, bei Medizintechnik-Herstellern etc. z. B. auch durch eine Tätigkeit bei Behörden, im Rahmen einer Promotion etc. erworben worden sein kann), die den akademischen Grad Master of Science erwerben möchten. Die Zielgruppe des Zertifikatsstudiengangs sind in erster Linie diejenigen, die bereits einen Master- oder Diplomabschluss besitzen und eine an ihren beruflichen Anforderungen orientierte fachlich ausgewiesene Weiterbildung im Bereich der Medizinphysik bzw. -technik benötigen, jedoch (vorerst) keinen weiteren akademischen Grad anstreben. Er ist auch für Personen geeignet, die in diesen vielfältigen Tätigkeitsbereich einsteigen möchten und bisher noch keine Berufserfahrung darin erwerben konnten. Im Vergleich zum Zertifikatsstudiengang ist der Masterstudiengang länger und schließt mit einer wissenschaftlichen Abschlussarbeit, der Masterarbeit, ab. Beide Studiengänge qualifizieren für eine Tätigkeit in medizinischen Versorgungseinrichtungen. Weitere Einsatzfelder sind unter anderem Bereiche der Forschung und Entwicklung medizinischer Geräte und Verfahren, Prüf-, Kontroll- und Wartungswesen, Vertrieb sowie Schulung.